明天启七年，北镇抚司锦衣卫沈炼（张震 饰）在一次扫除乱党任务中，为救画师北斋（杨幂 饰），将同僚凌云铠（武强 饰）灭口。此后一方面要摆脱来自陆文昭（张译 饰）、裴纶（雷佳音 饰）的质疑与调查，一方面又在神秘女子的要挟下放火烧了锦衣卫经历司。裹挟在乱世，沈炼与北斋情陷其中，却越陷越深。而在这一切的背后，巨大阴谋正暗中布局。众生如蝼蚁囿于修罗场，逆鳞之战，一触即发…

《少年锦衣卫 第一季》为第00集至第13集，第一季首集《00 序章》为2016年12月29日上线。《少年锦衣卫 第二季》为第14集至第27集，第二季首集《14 序章》为2017年9月28日上线。大明初起，明太祖朱元璋设锦衣卫亲军指挥使司，后分设南北镇抚司，稽查百官，权势煊赫。锦衣卫沿袭百年，南北镇抚司势如水火，相争不下。朝堂党争激烈，江湖盗匪猖獗，盛世繁华之下，却隐藏着汹涌暗流……

明朝晚期，锦衣卫镇抚使刘其忠因不甘向东厂称臣，被举家灭门，行刑者众多，其首名唤“金罗刹”。二十年后，幸存的两位刘家后人化名尹阡、尹陌，为寻找仇人“金罗刹”，兄弟二人先后进锦衣卫入职。